Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMEM171Q8WVE6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TMEM171Q8WVE6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms