Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GADD45GIP1Q8TAE8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms