Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HJURPQ8NCD3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HJURPQ8NCD3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms