Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCE1Q8N0S2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCE1Q8N0S2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms