Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLFN12Q8IYM2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLFN12Q8IYM2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLFN12Q8IYM2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms