Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CTU1Q7Z7A3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTU1Q7Z7A3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms