Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUP54Q7Z3B4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NUP54Q7Z3B4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms