Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
OTOP1Q7RTM1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
OTOP1Q7RTM1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms