Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWJ1

STXBP4, Syntaxin-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STXBP4Q6ZWJ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STXBP4Q6ZWJ1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STXBP4Q6ZWJ1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms