Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms