Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms