Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FOXD4L3Q6VB84 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FOXD4L3Q6VB84 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms