Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SUSD1Q6UWL2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms