Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNIP4Q6PIL6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms