Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LRRC8EQ6NSJ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LRRC8EQ6NSJ5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms