Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPECC1LQ69YQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPECC1LQ69YQ0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms