Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
WSCD1Q658N2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WSCD1Q658N2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms