Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RNF123Q5XPI4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RNF123Q5XPI4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms