Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPANXN1Q5VSR9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPANXN1Q5VSR9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms