Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBXN11Q5T124 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBXN11Q5T124 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms