Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPIN3Q5JUX0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPIN3Q5JUX0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms