Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KHDC3LQ587J8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms