Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDRD12Q587J7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms