Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAN2Q504Q3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAN2Q504Q3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms