Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GREB1Q4ZG55 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms