Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SP6Q3SY56 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SP6Q3SY56 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms