Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CEACAM16Q2WEN9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms