Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MICBQ29980 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MICBQ29980 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MICBQ29980 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MICBQ29980 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MICBQ29980 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MICBQ29980 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MICBQ29980 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MICBQ29980 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MICBQ29980 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MICBQ29980 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MICBQ29980 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms