Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPROQ16827 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPROQ16827 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
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