Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FOXD1Q16676 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
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