Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK4Q16654 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PDK4Q16654 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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PDK4Q16654 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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