Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VPS72Q15906 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VPS72Q15906 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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