Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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VAMP3Q15836 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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