Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRADDQ15628 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRADDQ15628 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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