Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PUM3Q15397 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PUM3Q15397 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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