Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.041e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.721e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-225ENST00000533614 553 ntTSL 425.63■■□□□ 1.691e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-226ENST00000533647 548 ntTSL 324.71■■□□□ 1.551e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.541e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-208ENST00000470787 1544 ntTSL 224.56■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-203ENST00000412341 1916 ntTSL 523.94■■□□□ 1.421e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-224ENST00000624247 1263 ntTSL 523.58■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-220ENST00000496411 1064 ntTSL 323.35■■□□□ 1.331e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-212ENST00000455608 648 ntTSL 322.91■■□□□ 1.261e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-212ENST00000478107 1051 ntTSL 522.83■■□□□ 1.251e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-224ENST00000530986 595 ntTSL 422.64■■□□□ 1.211e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-219ENST00000496231 656 ntTSL 322.56■■□□□ 1.21e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.931e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-218ENST00000496053 694 ntTSL 320.63■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-215ENST00000483791 681 ntTSL 320.4■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-221ENST00000497847 1031 ntTSL 220.4■□□□□ 0.861e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-214ENST00000483223 901 ntTSL 319.89■□□□□ 0.771e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.731e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-227ENST00000533927 2026 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-222ENST00000528141 576 ntTSL 419.24■□□□□ 0.671e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-223ENST00000530699 896 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.481e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SPNS1-205ENST00000561868 441 ntTSL 517.34■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 RAB6B-202ENST00000460865 723 ntTSL 516.62■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 INTS11-234ENST00000527383 668 ntTSL 316.06■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 INTS11-214ENST00000470030 2369 ntTSL 515.24■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-230ENST00000534660 552 ntTSL 314.62□□□□□ -0.071e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-219ENST00000493335 2937 ntTSL 214.46□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-213ENST00000460658 5080 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ZNF692-206ENST00000463519 2704 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.121e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 INTS11-213ENST00000467408 639 ntTSL 213.46□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 RAB6B-204ENST00000477759 586 ntTSL 513.15□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-222ENST00000612341 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SMTN-218ENST00000489337 3560 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 RAB6B-207ENST00000543906 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SSBP3-215ENST00000533946 431 ntTSL 310.57□□□□□ -0.721e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SSBP3-212ENST00000528930 862 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SLC39A14-205ENST00000517370 839 ntTSL 314.68□□□□□ -0.067e-7■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 TUBA1B-206ENST00000550367 835 ntTSL 310.61□□□□□ -0.713e-13■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 516.25■□□□□ 0.199e-9■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-209ENST00000583976 570 ntTSL 217.3■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.121e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-206ENST00000581068 595 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-204ENST00000578519 894 ntTSL 311.98□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-208ENST00000583927 533 ntTSL 211.06□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 KLHDC4-221ENST00000568346 343 ntTSL 49.03□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -11e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 SKA2-210ENST00000584089 229 ntTSL 45.58□□□□□ -1.521e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.382e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 TXNDC5-202ENST00000460138 2704 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-11■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 22.1
PCBP1Q15365 ALG3-213ENST00000485912 995 ntTSL 211.93□□□□□ -0.51e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.811e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.361e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.341e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.121e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-207ENST00000525995 592 ntTSL 423.87■■□□□ 1.412e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-218ENST00000531416 1969 ntTSL 217.26■□□□□ 0.352e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-211ENST00000527526 555 ntTSL 413.94□□□□□ -0.182e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-220ENST00000531647 579 ntTSL 413.94□□□□□ -0.182e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-221ENST00000532082 1069 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.412e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.912e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-227ENST00000533485 806 ntTSL 28.47□□□□□ -1.052e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.122e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.22e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.32e-14■■■■□ 22
PCBP1Q15365 CCDC26-202ENST00000520048 904 ntTSL 39.32□□□□□ -0.925e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 CCDC26-203ENST00000523151 1496 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.125e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.235e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.147e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.045e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.351e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.652e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.15e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.345e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.515e-8■■■■□ 22
PCBP1Q15365 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.178e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.028e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 RNF123-210ENST00000487805 5882 ntTSL 213.66□□□□□ -0.228e-7■■■■□ 22
PCBP1Q15365 RNF123-209ENST00000486102 4564 ntTSL 1 (best)12.33□□□□□ -0.448e-7■■■■□ 22
Retrieved 100 of 13,035 protein–RNA pairs in 263.2 ms