Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAM2Q15035 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.5 ms