Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
CHD4Q14839 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CHD4Q14839 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHD4Q14839 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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