Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SQLEQ14534 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SQLEQ14534 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms