Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNGB1Q14028 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
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CNGB1Q14028 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
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CNGB1Q14028 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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