Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATRQ13535 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRQ13535 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRQ13535 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRQ13535 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms