Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NME3Q13232 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NME3Q13232 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME3Q13232 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NME3Q13232 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NME3Q13232 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NME3Q13232 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NME3Q13232 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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