Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRDNQ13061 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRDNQ13061 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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