Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFEMP1Q12805 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFEMP1Q12805 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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