Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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KCNMA1Q12791 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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KCNMA1Q12791 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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KCNMA1Q12791 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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KCNMA1Q12791 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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KCNMA1Q12791 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNMA1Q12791 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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