Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCAPQ12770 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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