Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RBBP4Q09028 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms