Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC3A1Q07837 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC3A1Q07837 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms