Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EGR3Q06889 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EGR3Q06889 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms