Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PAX8Q06710 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PAX8Q06710 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms